BioInfo - Introduction Python

BioInfo - Introduction à Python

contact: ludwig@univ-brest.fr

1. Python

Python est un langage qui peut être

  • Interprété (on tape une commande et elle est immédiatement exécuté). Pour cela il suffit de rentrer dans l'interpréteur python, en tapant python3 (ctrl+D pour quitter)
  • scripts. On écrit dans un fichier une liste de commandes qui seront exécutées séquentiellement. Pour cela il faut tape python3 LeNomDuFichier.py

2. Commandes

2.1. Opérations Mathématiques simples

3+6

python
58-29

python
4*8

python
51/17

python

2.2. Texte

print("Bonjour je m'appelle XXXXXXX")

python

Concaténation avec ","

print("J'ai 27 ans. Ca fait",27*365.25,"jours")

python

3. Variables

Une variable est un objet défini par un nom et qui contient une valeur.

L'affectation d'une valeur à une variable se fait avec =

pi=3.141592

python

L'appelle à une variable est remplacé par sa valeur

pi

python
print("Ma variable contient la valeur",pi)

python
rayon=17
hauteur=33
airebase=rayon*rayon*pi
volumecylindre=airebase*hauteur
print("Un cylindre de rayon",rayon,"et de hauteur",hauteur)
print("L'aire de sa base est",airebase)
print("Le volume du cylindre est",volumecylindre)

python

On peut réaffecter une nouvelle valeur à une variable, ce qui va écraser la précédente. 

x=27
x
x=33
x
x=x+x
x

python

Avec "" une variable peut également contenir du text

name="Bond"
firstname="James"
print("My name is",name,firstname,name)

python

La valeur d'une variable peut être demandé à l'utilisateur interactivement avec input("Un petit texte")

name=input("Bonjour, quel est ton nom ? ")

python

S'il s'agit d'un nombre, une convertion text -> number est requise avec int() pour un nombre entier ou float() pour un nombre à virgule

age=int(input("Quel est ton age ? "))

python

Les variables sont bien mémorisées

print("Enchanté",name,"En 2060 ans tu auras",age+2060-2022,"ans !")

python

4. Programme

Toutes les commandes peuvent être stockées dans un fichier NomDuFichier.py et executé sous la forme d'un programme avec python3 NomDuFichier.py

Exemple : Ouvrir un editeur de texte en tapant gedit&

Dedans copier les commandes que nous venons de voir:

name=input("Bonjour, quel est ton nom ? ")
age=int(input("Quel est ton age ? "))
print("Enchanté",name,"En 2060 ans tu auras",age+2060-2022,"ans !")

python

Cliquer sur "save" et enregistrer le fichier sous welcome.py

Taper la commande suivante pour executer votre programme : python3 welcome.py

Exercice 1 Volume

Ecrire un programme qui demande

  • la longueur
  • la largeur
  • la hauteur

d'une boite et affiche son volume.

5. Conditionnelles

Les conditionnelles permettent d'executer certaines commandes d'un programme que sous certaines conditions.

La syntaxe est la suivante ⚠ l'indentation (les espaces en début de lignes) est importante en python

if CONDITION:
    code executé
    uniquement si
    CONDITION est vrai

python

ou

if CONDITION:
    code executé
    uniquement si
    CONDITION est vrai
else:
    code executé si 
    CONDITION est faux

python

5.1. Les opérateurs de comparaisons

Comme = est utilisé pour l'affectation, écrire a=b va remplacer la valeur de a par celle de b. Voici quelques opérateurs:

  • Equals: a == b
  • Not Equals: a != b
  • Less than: a < b
  • Less than or equal to: a <= b
  • Greater than: a > b
  • Greater than or equal to: a >= b

Dans l'interpreteur python, taper:

a=13
b=24
a==b
a!=b
a<b
a<=b
a>b
a>=b

Python répond True que l'opération est vrai et False quand elle est fausse

Ecrire le programme suivant (par exemple dans l'éditeur de texte gedit): 

a=int(input("Valeur pour a:"))
b=int(input("Valeur pour b:"))

if a==b:
    print("a et b sont égaux. Leur valeur est",a)
else:
    print("a et b sont différents")

python

Enregistrer le programme sous le nom if.py et exécuter le 2 fois (avec des valeurs identiques et différentes)

6. Boucles

7. Fonctions